甘肃省农业科学院蔬菜研究所成立于1978年10月，其前身为甘肃省农科院园艺研究所（成立于1958年10月）。研究室组设有西瓜与甜瓜新品种选育、辣椒新品种选育、番茄新品种选育（番茄、特菜）、资源利用研究（黄瓜、南瓜、花椰菜菜）、食用菌、设施栽培（栽培技术、栽培生理、设施工程）等6研究室，是甘肃省园艺工程学会、甘肃省食用菌协会的依托单位。
主要开展蔬菜、瓜类、食用菌等资源创新与利用开发、优良品种选育；高产优质蔬菜栽培技术研究与示范；设施园艺生产关键技术研究与设备开发；蔬菜生产新技术推广、技术咨询与培训等工作。全所现有科研仪器88台件，试验地、温室30多亩，建设有日光温室4座，钢架大棚16座，食用菌实验楼700多平米。
蔬菜所现有职工51人，科技人员47人，其中研究员4人，副研究员12人，中级职称19人，初级职称9人，未定级3人。有硕士11人，在读博士5人，在读硕士1人，硕士研究生导师4人，入选甘肃省“333”、“555”人才工程3人。
以蔬菜、瓜类作物杂种优势利用为主要育种技术，探索常规育种技术与生物技术相结合的育种新技术研究；重点开展瓜菜（辣椒、西瓜、甜瓜、番茄、黄瓜、菜花、南瓜等）与食用菌新品种选育及专用品种选育；进行具有西北特色的栽培设施建造技术研究，设施环境条件下蔬菜、瓜类、食用菌等的规范化栽培技术研究及环境要素对作物生长发育的机理研究等方面的技术创新与示范；开展高产、优质、低成本绿色产品生产技术研究，重点进行高原夏菜先进生产技术集成创新研究与产业化示范基地建设；大幅度提高品种、新技术、新产品对农业生产的贡献率和植物自身的生产能力。为甘肃省蔬菜产业发展提供科技支撑。
目前本所承担国家、省、部级攻关与推广项目16项，内容涉及设施园艺研究、辣椒、黄瓜、番茄、花椰菜、西甜瓜、食用菌育种及栽培、品种资源、植物生理、植物遗传研究等诸多领域。